Protein–RNA interactions for Protein: Q2TV84

Trpm1, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm1Q2TV84 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trpm1Q2TV84 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trpm1Q2TV84 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trpm1Q2TV84 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trpm1Q2TV84 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trpm1Q2TV84 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trpm1Q2TV84 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trpm1Q2TV84 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trpm1Q2TV84 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trpm1Q2TV84 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trpm1Q2TV84 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trpm1Q2TV84 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trpm1Q2TV84 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trpm1Q2TV84 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Trpm1Q2TV84 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trpm1Q2TV84 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Trpm1Q2TV84 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trpm1Q2TV84 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trpm1Q2TV84 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Trpm1Q2TV84 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trpm1Q2TV84 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Trpm1Q2TV84 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trpm1Q2TV84 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trpm1Q2TV84 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trpm1Q2TV84 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trpm1Q2TV84 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trpm1Q2TV84 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trpm1Q2TV84 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trpm1Q2TV84 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trpm1Q2TV84 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trpm1Q2TV84 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trpm1Q2TV84 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trpm1Q2TV84 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trpm1Q2TV84 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Trpm1Q2TV84 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trpm1Q2TV84 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trpm1Q2TV84 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trpm1Q2TV84 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trpm1Q2TV84 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trpm1Q2TV84 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trpm1Q2TV84 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trpm1Q2TV84 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trpm1Q2TV84 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trpm1Q2TV84 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trpm1Q2TV84 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Trpm1Q2TV84 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trpm1Q2TV84 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trpm1Q2TV84 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trpm1Q2TV84 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trpm1Q2TV84 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trpm1Q2TV84 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trpm1Q2TV84 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trpm1Q2TV84 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trpm1Q2TV84 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trpm1Q2TV84 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trpm1Q2TV84 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpm1Q2TV84 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpm1Q2TV84 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpm1Q2TV84 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpm1Q2TV84 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpm1Q2TV84 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpm1Q2TV84 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpm1Q2TV84 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpm1Q2TV84 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpm1Q2TV84 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpm1Q2TV84 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpm1Q2TV84 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpm1Q2TV84 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpm1Q2TV84 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpm1Q2TV84 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpm1Q2TV84 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trpm1Q2TV84 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trpm1Q2TV84 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Trpm1Q2TV84 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trpm1Q2TV84 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trpm1Q2TV84 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trpm1Q2TV84 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trpm1Q2TV84 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trpm1Q2TV84 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trpm1Q2TV84 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trpm1Q2TV84 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trpm1Q2TV84 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trpm1Q2TV84 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trpm1Q2TV84 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trpm1Q2TV84 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Trpm1Q2TV84 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trpm1Q2TV84 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trpm1Q2TV84 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trpm1Q2TV84 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trpm1Q2TV84 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Trpm1Q2TV84 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trpm1Q2TV84 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trpm1Q2TV84 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trpm1Q2TV84 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trpm1Q2TV84 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trpm1Q2TV84 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Trpm1Q2TV84 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trpm1Q2TV84 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trpm1Q2TV84 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trpm1Q2TV84 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms