Protein–RNA interactions for Protein: Q2PFD7

Psd3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psd3Q2PFD7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Psd3Q2PFD7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Psd3Q2PFD7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Psd3Q2PFD7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Psd3Q2PFD7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psd3Q2PFD7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psd3Q2PFD7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psd3Q2PFD7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psd3Q2PFD7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psd3Q2PFD7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Psd3Q2PFD7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms