Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chrna5Q2MKA5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chrna5Q2MKA5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chrna5Q2MKA5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chrna5Q2MKA5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chrna5Q2MKA5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chrna5Q2MKA5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chrna5Q2MKA5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chrna5Q2MKA5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chrna5Q2MKA5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Chrna5Q2MKA5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chrna5Q2MKA5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chrna5Q2MKA5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chrna5Q2MKA5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chrna5Q2MKA5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chrna5Q2MKA5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chrna5Q2MKA5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chrna5Q2MKA5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chrna5Q2MKA5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chrna5Q2MKA5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Chrna5Q2MKA5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chrna5Q2MKA5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chrna5Q2MKA5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chrna5Q2MKA5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chrna5Q2MKA5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chrna5Q2MKA5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chrna5Q2MKA5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Chrna5Q2MKA5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chrna5Q2MKA5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Chrna5Q2MKA5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chrna5Q2MKA5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chrna5Q2MKA5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chrna5Q2MKA5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Chrna5Q2MKA5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chrna5Q2MKA5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chrna5Q2MKA5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chrna5Q2MKA5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Chrna5Q2MKA5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chrna5Q2MKA5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chrna5Q2MKA5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chrna5Q2MKA5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chrna5Q2MKA5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chrna5Q2MKA5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chrna5Q2MKA5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Chrna5Q2MKA5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chrna5Q2MKA5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chrna5Q2MKA5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Chrna5Q2MKA5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Chrna5Q2MKA5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chrna5Q2MKA5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chrna5Q2MKA5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chrna5Q2MKA5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chrna5Q2MKA5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chrna5Q2MKA5 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chrna5Q2MKA5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Chrna5Q2MKA5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chrna5Q2MKA5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chrna5Q2MKA5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chrna5Q2MKA5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chrna5Q2MKA5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Chrna5Q2MKA5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Chrna5Q2MKA5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Chrna5Q2MKA5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Chrna5Q2MKA5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Chrna5Q2MKA5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Chrna5Q2MKA5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Chrna5Q2MKA5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms