Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Shroom4Q1W617 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
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Shroom4Q1W617 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
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Shroom4Q1W617 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Shroom4Q1W617 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Shroom4Q1W617 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
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Shroom4Q1W617 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Shroom4Q1W617 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Shroom4Q1W617 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Shroom4Q1W617 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Shroom4Q1W617 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Shroom4Q1W617 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Shroom4Q1W617 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Shroom4Q1W617 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Shroom4Q1W617 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Shroom4Q1W617 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Shroom4Q1W617 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Shroom4Q1W617 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Shroom4Q1W617 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Shroom4Q1W617 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Shroom4Q1W617 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Shroom4Q1W617 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Shroom4Q1W617 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
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