Protein–RNA interactions for Protein: Q14BI7

Tdrd9, ATP-dependent RNA helicase TDRD9, mousemouse

Predictions only

Length 1,383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd9Q14BI7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tdrd9Q14BI7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tdrd9Q14BI7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tdrd9Q14BI7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Tdrd9Q14BI7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Tdrd9Q14BI7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Tdrd9Q14BI7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tdrd9Q14BI7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tdrd9Q14BI7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tdrd9Q14BI7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tdrd9Q14BI7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tdrd9Q14BI7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tdrd9Q14BI7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tdrd9Q14BI7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Tdrd9Q14BI7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tdrd9Q14BI7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tdrd9Q14BI7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tdrd9Q14BI7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tdrd9Q14BI7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tdrd9Q14BI7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tdrd9Q14BI7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tdrd9Q14BI7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tdrd9Q14BI7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tdrd9Q14BI7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tdrd9Q14BI7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tdrd9Q14BI7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tdrd9Q14BI7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tdrd9Q14BI7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tdrd9Q14BI7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tdrd9Q14BI7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Tdrd9Q14BI7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tdrd9Q14BI7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tdrd9Q14BI7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tdrd9Q14BI7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tdrd9Q14BI7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tdrd9Q14BI7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tdrd9Q14BI7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tdrd9Q14BI7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tdrd9Q14BI7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tdrd9Q14BI7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tdrd9Q14BI7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tdrd9Q14BI7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tdrd9Q14BI7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tdrd9Q14BI7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tdrd9Q14BI7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Tdrd9Q14BI7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tdrd9Q14BI7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tdrd9Q14BI7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tdrd9Q14BI7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tdrd9Q14BI7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tdrd9Q14BI7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tdrd9Q14BI7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tdrd9Q14BI7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tdrd9Q14BI7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tdrd9Q14BI7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tdrd9Q14BI7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tdrd9Q14BI7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tdrd9Q14BI7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tdrd9Q14BI7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tdrd9Q14BI7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tdrd9Q14BI7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tdrd9Q14BI7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Tdrd9Q14BI7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tdrd9Q14BI7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tdrd9Q14BI7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tdrd9Q14BI7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tdrd9Q14BI7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tdrd9Q14BI7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tdrd9Q14BI7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tdrd9Q14BI7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tdrd9Q14BI7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tdrd9Q14BI7 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tdrd9Q14BI7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tdrd9Q14BI7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Tdrd9Q14BI7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tdrd9Q14BI7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tdrd9Q14BI7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tdrd9Q14BI7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tdrd9Q14BI7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tdrd9Q14BI7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tdrd9Q14BI7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tdrd9Q14BI7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Tdrd9Q14BI7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tdrd9Q14BI7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tdrd9Q14BI7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tdrd9Q14BI7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Tdrd9Q14BI7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Tdrd9Q14BI7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tdrd9Q14BI7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tdrd9Q14BI7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tdrd9Q14BI7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tdrd9Q14BI7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tdrd9Q14BI7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tdrd9Q14BI7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tdrd9Q14BI7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tdrd9Q14BI7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tdrd9Q14BI7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tdrd9Q14BI7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tdrd9Q14BI7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tdrd9Q14BI7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
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