Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gli2Q0VGT2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gli2Q0VGT2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gli2Q0VGT2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gli2Q0VGT2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gli2Q0VGT2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Gli2Q0VGT2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gli2Q0VGT2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gli2Q0VGT2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gli2Q0VGT2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gli2Q0VGT2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gli2Q0VGT2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Gli2Q0VGT2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gli2Q0VGT2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gli2Q0VGT2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gli2Q0VGT2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Gli2Q0VGT2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gli2Q0VGT2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gli2Q0VGT2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gli2Q0VGT2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gli2Q0VGT2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gli2Q0VGT2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gli2Q0VGT2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gli2Q0VGT2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gli2Q0VGT2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gli2Q0VGT2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gli2Q0VGT2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gli2Q0VGT2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Gli2Q0VGT2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gli2Q0VGT2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gli2Q0VGT2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gli2Q0VGT2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gli2Q0VGT2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gli2Q0VGT2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gli2Q0VGT2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gli2Q0VGT2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gli2Q0VGT2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gli2Q0VGT2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gli2Q0VGT2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gli2Q0VGT2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gli2Q0VGT2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gli2Q0VGT2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gli2Q0VGT2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gli2Q0VGT2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gli2Q0VGT2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gli2Q0VGT2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gli2Q0VGT2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gli2Q0VGT2 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gli2Q0VGT2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Gli2Q0VGT2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gli2Q0VGT2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gli2Q0VGT2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gli2Q0VGT2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gli2Q0VGT2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gli2Q0VGT2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gli2Q0VGT2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gli2Q0VGT2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gli2Q0VGT2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gli2Q0VGT2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gli2Q0VGT2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gli2Q0VGT2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gli2Q0VGT2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gli2Q0VGT2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gli2Q0VGT2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gli2Q0VGT2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gli2Q0VGT2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Gli2Q0VGT2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gli2Q0VGT2 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gli2Q0VGT2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gli2Q0VGT2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Gli2Q0VGT2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gli2Q0VGT2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gli2Q0VGT2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gli2Q0VGT2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gli2Q0VGT2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gli2Q0VGT2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gli2Q0VGT2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gli2Q0VGT2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gli2Q0VGT2 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gli2Q0VGT2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gli2Q0VGT2 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Gli2Q0VGT2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gli2Q0VGT2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gli2Q0VGT2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gli2Q0VGT2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gli2Q0VGT2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gli2Q0VGT2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gli2Q0VGT2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gli2Q0VGT2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gli2Q0VGT2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gli2Q0VGT2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gli2Q0VGT2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gli2Q0VGT2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gli2Q0VGT2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gli2Q0VGT2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gli2Q0VGT2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gli2Q0VGT2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gli2Q0VGT2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gli2Q0VGT2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gli2Q0VGT2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms