Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc162pQ0VG85 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc162pQ0VG85 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms