Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rundc1Q0VDN7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rundc1Q0VDN7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms