Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBM2

Fam83b, Protein FAM83B, mousemouse

Predictions only

Length 1,012 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam83bQ0VBM2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam83bQ0VBM2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam83bQ0VBM2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam83bQ0VBM2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam83bQ0VBM2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam83bQ0VBM2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam83bQ0VBM2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam83bQ0VBM2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam83bQ0VBM2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam83bQ0VBM2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam83bQ0VBM2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam83bQ0VBM2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam83bQ0VBM2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam83bQ0VBM2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam83bQ0VBM2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam83bQ0VBM2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam83bQ0VBM2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam83bQ0VBM2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam83bQ0VBM2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam83bQ0VBM2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam83bQ0VBM2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam83bQ0VBM2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam83bQ0VBM2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam83bQ0VBM2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam83bQ0VBM2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam83bQ0VBM2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam83bQ0VBM2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam83bQ0VBM2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam83bQ0VBM2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam83bQ0VBM2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam83bQ0VBM2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam83bQ0VBM2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam83bQ0VBM2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam83bQ0VBM2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam83bQ0VBM2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam83bQ0VBM2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam83bQ0VBM2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam83bQ0VBM2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam83bQ0VBM2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam83bQ0VBM2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam83bQ0VBM2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam83bQ0VBM2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam83bQ0VBM2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam83bQ0VBM2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam83bQ0VBM2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam83bQ0VBM2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam83bQ0VBM2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam83bQ0VBM2 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam83bQ0VBM2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam83bQ0VBM2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam83bQ0VBM2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam83bQ0VBM2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam83bQ0VBM2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam83bQ0VBM2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam83bQ0VBM2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam83bQ0VBM2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fam83bQ0VBM2 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms