Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Neurl1bQ0MW30 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Neurl1bQ0MW30 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Neurl1bQ0MW30 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Neurl1bQ0MW30 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Neurl1bQ0MW30 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Neurl1bQ0MW30 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Neurl1bQ0MW30 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Neurl1bQ0MW30 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Neurl1bQ0MW30 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Neurl1bQ0MW30 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Neurl1bQ0MW30 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Neurl1bQ0MW30 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Neurl1bQ0MW30 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Neurl1bQ0MW30 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Neurl1bQ0MW30 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Neurl1bQ0MW30 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Neurl1bQ0MW30 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Neurl1bQ0MW30 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Neurl1bQ0MW30 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Neurl1bQ0MW30 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Neurl1bQ0MW30 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Neurl1bQ0MW30 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Neurl1bQ0MW30 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Neurl1bQ0MW30 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Neurl1bQ0MW30 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms