Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ubxn2bQ0KL01 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ubxn2bQ0KL01 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms