Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnnm1Q0GA42 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnnm1Q0GA42 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cnnm1Q0GA42 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnnm1Q0GA42 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnnm1Q0GA42 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnnm1Q0GA42 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnnm1Q0GA42 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnnm1Q0GA42 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnnm1Q0GA42 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnnm1Q0GA42 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnnm1Q0GA42 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnnm1Q0GA42 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnnm1Q0GA42 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnnm1Q0GA42 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnnm1Q0GA42 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnnm1Q0GA42 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnnm1Q0GA42 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnnm1Q0GA42 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnnm1Q0GA42 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnnm1Q0GA42 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnnm1Q0GA42 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnnm1Q0GA42 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnnm1Q0GA42 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnnm1Q0GA42 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnnm1Q0GA42 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnnm1Q0GA42 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cnnm1Q0GA42 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cnnm1Q0GA42 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cnnm1Q0GA42 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnnm1Q0GA42 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms