Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cass4Q08EC4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms