Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hoxc4Q08624 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Hoxc4Q08624 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms