Protein–RNA interactions for Protein: Q07105

Gdf9, Growth/differentiation factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf9Q07105 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gdf9Q07105 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gdf9Q07105 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gdf9Q07105 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gdf9Q07105 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gdf9Q07105 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gdf9Q07105 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gdf9Q07105 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gdf9Q07105 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gdf9Q07105 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gdf9Q07105 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gdf9Q07105 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gdf9Q07105 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gdf9Q07105 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gdf9Q07105 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gdf9Q07105 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gdf9Q07105 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gdf9Q07105 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gdf9Q07105 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gdf9Q07105 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gdf9Q07105 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gdf9Q07105 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms