Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Siah1bQ06985 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Siah1bQ06985 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.1 ms