Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPINDOCQ05AH6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SPINDOCQ05AH6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms