Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smpd1Q04519 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smpd1Q04519 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms