Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mmp11Q02853 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms