Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gjb5Q02739 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms