Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mc1rQ01727 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mc1rQ01727 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms