Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sec23aQ01405 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sec23aQ01405 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms