Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Top2aQ01320 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Top2aQ01320 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Top2aQ01320 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Top2aQ01320 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Top2aQ01320 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Top2aQ01320 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Top2aQ01320 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Top2aQ01320 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Top2aQ01320 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Top2aQ01320 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Top2aQ01320 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Top2aQ01320 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Top2aQ01320 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Top2aQ01320 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Top2aQ01320 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Top2aQ01320 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Top2aQ01320 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Top2aQ01320 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Top2aQ01320 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Top2aQ01320 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Top2aQ01320 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Top2aQ01320 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Top2aQ01320 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Top2aQ01320 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Top2aQ01320 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Top2aQ01320 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Top2aQ01320 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Top2aQ01320 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Top2aQ01320 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Top2aQ01320 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Top2aQ01320 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Top2aQ01320 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Top2aQ01320 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Top2aQ01320 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Top2aQ01320 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Top2aQ01320 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Top2aQ01320 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Top2aQ01320 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Top2aQ01320 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Top2aQ01320 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Top2aQ01320 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Top2aQ01320 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Top2aQ01320 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Top2aQ01320 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Top2aQ01320 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Top2aQ01320 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Top2aQ01320 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Top2aQ01320 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Top2aQ01320 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Top2aQ01320 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Top2aQ01320 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Top2aQ01320 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Top2aQ01320 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Top2aQ01320 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Top2aQ01320 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Top2aQ01320 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
Top2aQ01320 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Top2aQ01320 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Top2aQ01320 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Top2aQ01320 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Top2aQ01320 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Top2aQ01320 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Top2aQ01320 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Top2aQ01320 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Top2aQ01320 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Top2aQ01320 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Top2aQ01320 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Top2aQ01320 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Top2aQ01320 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Top2aQ01320 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Top2aQ01320 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Top2aQ01320 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Top2aQ01320 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Top2aQ01320 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Top2aQ01320 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Top2aQ01320 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Top2aQ01320 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Top2aQ01320 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Top2aQ01320 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Top2aQ01320 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Top2aQ01320 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Top2aQ01320 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Top2aQ01320 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Top2aQ01320 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Top2aQ01320 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Top2aQ01320 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Top2aQ01320 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Top2aQ01320 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Top2aQ01320 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Top2aQ01320 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Top2aQ01320 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Top2aQ01320 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Top2aQ01320 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Top2aQ01320 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Top2aQ01320 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Top2aQ01320 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Top2aQ01320 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Top2aQ01320 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Top2aQ01320 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms