Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SelpQ01102 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SelpQ01102 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SelpQ01102 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SelpQ01102 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SelpQ01102 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SelpQ01102 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SelpQ01102 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SelpQ01102 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SelpQ01102 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SelpQ01102 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SelpQ01102 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SelpQ01102 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SelpQ01102 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SelpQ01102 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SelpQ01102 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SelpQ01102 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SelpQ01102 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SelpQ01102 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SelpQ01102 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SelpQ01102 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SelpQ01102 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SelpQ01102 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SelpQ01102 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SelpQ01102 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SelpQ01102 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SelpQ01102 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SelpQ01102 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SelpQ01102 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SelpQ01102 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SelpQ01102 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SelpQ01102 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SelpQ01102 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SelpQ01102 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SelpQ01102 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SelpQ01102 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SelpQ01102 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SelpQ01102 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SelpQ01102 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SelpQ01102 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SelpQ01102 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SelpQ01102 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SelpQ01102 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SelpQ01102 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SelpQ01102 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SelpQ01102 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SelpQ01102 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SelpQ01102 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SelpQ01102 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SelpQ01102 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SelpQ01102 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SelpQ01102 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SelpQ01102 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SelpQ01102 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SelpQ01102 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SelpQ01102 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SelpQ01102 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SelpQ01102 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SelpQ01102 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SelpQ01102 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SelpQ01102 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SelpQ01102 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SelpQ01102 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SelpQ01102 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SelpQ01102 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SelpQ01102 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SelpQ01102 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SelpQ01102 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SelpQ01102 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SelpQ01102 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SelpQ01102 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SelpQ01102 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SelpQ01102 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SelpQ01102 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SelpQ01102 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SelpQ01102 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SelpQ01102 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SelpQ01102 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SelpQ01102 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SelpQ01102 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SelpQ01102 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SelpQ01102 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SelpQ01102 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SelpQ01102 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SelpQ01102 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SelpQ01102 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SelpQ01102 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SelpQ01102 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SelpQ01102 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SelpQ01102 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SelpQ01102 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SelpQ01102 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SelpQ01102 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SelpQ01102 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SelpQ01102 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SelpQ01102 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SelpQ01102 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SelpQ01102 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SelpQ01102 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SelpQ01102 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms