Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Grin2cQ01098 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin2cQ01098 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms