Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PrcdQ00LT2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
PrcdQ00LT2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms