Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Stx2Q00262 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Stx2Q00262 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms