Protein–RNA interactions for Protein: P97460

Npas2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas2P97460 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Npas2P97460 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Npas2P97460 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Npas2P97460 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Npas2P97460 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Npas2P97460 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Npas2P97460 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Npas2P97460 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Npas2P97460 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Npas2P97460 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Npas2P97460 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Npas2P97460 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Npas2P97460 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Npas2P97460 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Npas2P97460 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Npas2P97460 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Npas2P97460 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Npas2P97460 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Npas2P97460 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Npas2P97460 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Npas2P97460 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Npas2P97460 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Npas2P97460 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Npas2P97460 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Npas2P97460 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Npas2P97460 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Npas2P97460 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Npas2P97460 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Npas2P97460 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Npas2P97460 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Npas2P97460 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Npas2P97460 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Npas2P97460 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Npas2P97460 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Npas2P97460 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Npas2P97460 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Npas2P97460 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Npas2P97460 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Npas2P97460 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Npas2P97460 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Npas2P97460 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Npas2P97460 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Npas2P97460 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Npas2P97460 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Npas2P97460 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Npas2P97460 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Npas2P97460 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Npas2P97460 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Npas2P97460 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Npas2P97460 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Npas2P97460 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Npas2P97460 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Npas2P97460 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Npas2P97460 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms