Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arf1P84078 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arf1P84078 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arf1P84078 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arf1P84078 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arf1P84078 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arf1P84078 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arf1P84078 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Arf1P84078 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Arf1P84078 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arf1P84078 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arf1P84078 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arf1P84078 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arf1P84078 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arf1P84078 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Arf1P84078 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arf1P84078 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arf1P84078 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arf1P84078 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Arf1P84078 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arf1P84078 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arf1P84078 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms