Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rad50P70388 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rad50P70388 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rad50P70388 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rad50P70388 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rad50P70388 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rad50P70388 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rad50P70388 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rad50P70388 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rad50P70388 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rad50P70388 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rad50P70388 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rad50P70388 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Rad50P70388 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad50P70388 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad50P70388 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad50P70388 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad50P70388 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad50P70388 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad50P70388 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad50P70388 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rad50P70388 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad50P70388 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad50P70388 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad50P70388 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad50P70388 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad50P70388 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad50P70388 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad50P70388 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rad50P70388 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rad50P70388 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rad50P70388 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad50P70388 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad50P70388 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rad50P70388 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rad50P70388 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rad50P70388 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rad50P70388 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rad50P70388 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rad50P70388 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rad50P70388 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rad50P70388 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rad50P70388 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rad50P70388 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rad50P70388 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rad50P70388 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rad50P70388 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rad50P70388 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rad50P70388 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rad50P70388 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad50P70388 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rad50P70388 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms