Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chl1P70232 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Chl1P70232 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chl1P70232 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chl1P70232 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Chl1P70232 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Chl1P70232 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chl1P70232 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chl1P70232 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chl1P70232 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chl1P70232 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chl1P70232 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chl1P70232 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chl1P70232 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chl1P70232 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chl1P70232 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chl1P70232 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chl1P70232 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chl1P70232 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chl1P70232 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chl1P70232 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chl1P70232 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chl1P70232 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chl1P70232 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chl1P70232 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chl1P70232 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chl1P70232 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chl1P70232 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chl1P70232 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chl1P70232 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chl1P70232 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chl1P70232 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Chl1P70232 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Chl1P70232 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chl1P70232 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chl1P70232 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chl1P70232 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chl1P70232 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chl1P70232 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chl1P70232 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chl1P70232 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chl1P70232 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chl1P70232 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chl1P70232 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chl1P70232 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chl1P70232 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chl1P70232 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chl1P70232 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Chl1P70232 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Chl1P70232 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Chl1P70232 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chl1P70232 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chl1P70232 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chl1P70232 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chl1P70232 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chl1P70232 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chl1P70232 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chl1P70232 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chl1P70232 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chl1P70232 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chl1P70232 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chl1P70232 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chl1P70232 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chl1P70232 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chl1P70232 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chl1P70232 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chl1P70232 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Chl1P70232 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chl1P70232 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chl1P70232 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chl1P70232 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chl1P70232 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chl1P70232 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chl1P70232 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chl1P70232 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chl1P70232 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chl1P70232 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chl1P70232 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chl1P70232 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chl1P70232 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chl1P70232 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chl1P70232 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chl1P70232 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chl1P70232 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chl1P70232 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chl1P70232 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chl1P70232 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chl1P70232 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chl1P70232 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chl1P70232 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Chl1P70232 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chl1P70232 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chl1P70232 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms