Protein–RNA interactions for Protein: P70170

Abcc9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc9P70170 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Abcc9P70170 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Abcc9P70170 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Abcc9P70170 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Abcc9P70170 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Abcc9P70170 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Abcc9P70170 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Abcc9P70170 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Abcc9P70170 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Abcc9P70170 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Abcc9P70170 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Abcc9P70170 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Abcc9P70170 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Abcc9P70170 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Abcc9P70170 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Abcc9P70170 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
Abcc9P70170 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Abcc9P70170 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Abcc9P70170 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Abcc9P70170 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Abcc9P70170 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Abcc9P70170 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Abcc9P70170 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
Abcc9P70170 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Abcc9P70170 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Abcc9P70170 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Abcc9P70170 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Abcc9P70170 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Abcc9P70170 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Abcc9P70170 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Abcc9P70170 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Abcc9P70170 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
Abcc9P70170 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.38
Abcc9P70170 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
Abcc9P70170 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC36.13■■■■□ 3.38
Abcc9P70170 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Abcc9P70170 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Abcc9P70170 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Abcc9P70170 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Abcc9P70170 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Abcc9P70170 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Abcc9P70170 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Abcc9P70170 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Abcc9P70170 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Abcc9P70170 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Abcc9P70170 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Abcc9P70170 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Abcc9P70170 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
Abcc9P70170 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Abcc9P70170 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Abcc9P70170 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Abcc9P70170 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Abcc9P70170 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Abcc9P70170 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Abcc9P70170 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Abcc9P70170 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Abcc9P70170 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Abcc9P70170 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Abcc9P70170 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Abcc9P70170 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Abcc9P70170 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Abcc9P70170 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Abcc9P70170 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Abcc9P70170 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Abcc9P70170 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Abcc9P70170 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Abcc9P70170 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Abcc9P70170 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Abcc9P70170 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Abcc9P70170 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Abcc9P70170 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
Abcc9P70170 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Abcc9P70170 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Abcc9P70170 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Abcc9P70170 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Abcc9P70170 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Abcc9P70170 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Abcc9P70170 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Abcc9P70170 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Abcc9P70170 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Abcc9P70170 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Abcc9P70170 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
Abcc9P70170 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
Abcc9P70170 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Abcc9P70170 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Abcc9P70170 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Abcc9P70170 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Abcc9P70170 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Abcc9P70170 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Abcc9P70170 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
Abcc9P70170 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Abcc9P70170 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Abcc9P70170 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Abcc9P70170 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Abcc9P70170 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Abcc9P70170 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Abcc9P70170 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Abcc9P70170 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Abcc9P70170 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Abcc9P70170 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms