Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SbdsP70122 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SbdsP70122 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SbdsP70122 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SbdsP70122 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SbdsP70122 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SbdsP70122 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SbdsP70122 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SbdsP70122 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms