Protein–RNA interactions for Protein: P63143

Kcnab1, Voltage-gated potassium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnab1P63143 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcnab1P63143 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcnab1P63143 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcnab1P63143 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcnab1P63143 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Kcnab1P63143 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnab1P63143 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnab1P63143 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnab1P63143 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnab1P63143 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnab1P63143 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnab1P63143 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnab1P63143 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnab1P63143 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnab1P63143 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnab1P63143 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnab1P63143 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnab1P63143 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kcnab1P63143 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnab1P63143 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnab1P63143 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnab1P63143 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnab1P63143 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnab1P63143 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnab1P63143 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnab1P63143 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnab1P63143 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnab1P63143 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnab1P63143 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnab1P63143 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnab1P63143 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnab1P63143 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnab1P63143 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnab1P63143 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnab1P63143 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnab1P63143 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnab1P63143 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnab1P63143 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnab1P63143 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kcnab1P63143 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcnab1P63143 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcnab1P63143 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcnab1P63143 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcnab1P63143 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcnab1P63143 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcnab1P63143 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcnab1P63143 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcnab1P63143 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcnab1P63143 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcnab1P63143 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcnab1P63143 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcnab1P63143 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcnab1P63143 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcnab1P63143 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcnab1P63143 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcnab1P63143 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcnab1P63143 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcnab1P63143 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcnab1P63143 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kcnab1P63143 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kcnab1P63143 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kcnab1P63143 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kcnab1P63143 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kcnab1P63143 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnab1P63143 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnab1P63143 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnab1P63143 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnab1P63143 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnab1P63143 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnab1P63143 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnab1P63143 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnab1P63143 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnab1P63143 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnab1P63143 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnab1P63143 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnab1P63143 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnab1P63143 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnab1P63143 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnab1P63143 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnab1P63143 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnab1P63143 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnab1P63143 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnab1P63143 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnab1P63143 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnab1P63143 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnab1P63143 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnab1P63143 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnab1P63143 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnab1P63143 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnab1P63143 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnab1P63143 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnab1P63143 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnab1P63143 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnab1P63143 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnab1P63143 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnab1P63143 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnab1P63143 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnab1P63143 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnab1P63143 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnab1P63143 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms