Protein–RNA interactions for Protein: P63013

Prrx1, Paired mesoderm homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx1P63013 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prrx1P63013 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrx1P63013 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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