Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

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Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gabra1P62812 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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