Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps11P62281 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps11P62281 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps11P62281 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps11P62281 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps11P62281 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps11P62281 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps11P62281 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps11P62281 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps11P62281 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms