Protein–RNA interactions for Protein: P62080

Tspan5, Tetraspanin-5, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan5P62080 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tspan5P62080 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms