Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ActbP60710 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ActbP60710 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ActbP60710 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ActbP60710 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ActbP60710 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ActbP60710 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ActbP60710 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ActbP60710 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ActbP60710 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ActbP60710 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ActbP60710 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ActbP60710 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ActbP60710 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ActbP60710 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ActbP60710 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ActbP60710 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ActbP60710 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ActbP60710 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ActbP60710 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ActbP60710 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ActbP60710 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ActbP60710 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ActbP60710 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ActbP60710 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ActbP60710 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ActbP60710 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ActbP60710 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ActbP60710 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ActbP60710 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ActbP60710 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ActbP60710 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ActbP60710 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ActbP60710 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ActbP60710 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ActbP60710 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ActbP60710 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ActbP60710 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ActbP60710 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ActbP60710 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ActbP60710 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ActbP60710 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ActbP60710 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ActbP60710 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ActbP60710 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ActbP60710 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ActbP60710 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ActbP60710 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ActbP60710 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ActbP60710 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ActbP60710 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ActbP60710 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ActbP60710 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ActbP60710 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ActbP60710 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ActbP60710 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ActbP60710 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ActbP60710 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ActbP60710 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ActbP60710 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ActbP60710 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ActbP60710 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ActbP60710 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ActbP60710 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ActbP60710 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ActbP60710 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ActbP60710 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ActbP60710 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ActbP60710 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ActbP60710 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ActbP60710 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ActbP60710 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ActbP60710 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ActbP60710 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ActbP60710 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ActbP60710 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ActbP60710 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ActbP60710 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ActbP60710 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ActbP60710 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ActbP60710 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ActbP60710 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ActbP60710 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ActbP60710 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ActbP60710 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ActbP60710 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ActbP60710 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ActbP60710 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ActbP60710 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ActbP60710 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ActbP60710 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ActbP60710 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ActbP60710 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ActbP60710 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ActbP60710 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ActbP60710 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ActbP60710 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ActbP60710 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ActbP60710 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ActbP60710 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms