Protein–RNA interactions for Protein: P59470

Polr3b, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3bP59470 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Polr3bP59470 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms