Protein–RNA interactions for Protein: P59054

Csrnp1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp1P59054 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Csrnp1P59054 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Csrnp1P59054 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Csrnp1P59054 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Csrnp1P59054 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Csrnp1P59054 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Csrnp1P59054 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Csrnp1P59054 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Csrnp1P59054 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Csrnp1P59054 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Csrnp1P59054 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Csrnp1P59054 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Csrnp1P59054 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Csrnp1P59054 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Csrnp1P59054 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Csrnp1P59054 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Csrnp1P59054 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Csrnp1P59054 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Csrnp1P59054 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csrnp1P59054 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csrnp1P59054 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csrnp1P59054 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csrnp1P59054 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csrnp1P59054 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csrnp1P59054 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csrnp1P59054 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Csrnp1P59054 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csrnp1P59054 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Csrnp1P59054 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csrnp1P59054 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csrnp1P59054 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csrnp1P59054 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csrnp1P59054 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csrnp1P59054 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csrnp1P59054 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Csrnp1P59054 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csrnp1P59054 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csrnp1P59054 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csrnp1P59054 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csrnp1P59054 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Csrnp1P59054 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Csrnp1P59054 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csrnp1P59054 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csrnp1P59054 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csrnp1P59054 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csrnp1P59054 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csrnp1P59054 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csrnp1P59054 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csrnp1P59054 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csrnp1P59054 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csrnp1P59054 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csrnp1P59054 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csrnp1P59054 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csrnp1P59054 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csrnp1P59054 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csrnp1P59054 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csrnp1P59054 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csrnp1P59054 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csrnp1P59054 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csrnp1P59054 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csrnp1P59054 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csrnp1P59054 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csrnp1P59054 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csrnp1P59054 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Csrnp1P59054 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csrnp1P59054 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csrnp1P59054 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csrnp1P59054 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csrnp1P59054 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Csrnp1P59054 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csrnp1P59054 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csrnp1P59054 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csrnp1P59054 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csrnp1P59054 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csrnp1P59054 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csrnp1P59054 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csrnp1P59054 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csrnp1P59054 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csrnp1P59054 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csrnp1P59054 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csrnp1P59054 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csrnp1P59054 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Csrnp1P59054 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Csrnp1P59054 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Csrnp1P59054 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Csrnp1P59054 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Csrnp1P59054 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Csrnp1P59054 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Csrnp1P59054 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Csrnp1P59054 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Csrnp1P59054 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csrnp1P59054 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csrnp1P59054 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csrnp1P59054 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csrnp1P59054 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csrnp1P59054 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csrnp1P59054 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csrnp1P59054 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csrnp1P59054 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csrnp1P59054 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms