Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NcstnP57716 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NcstnP57716 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NcstnP57716 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NcstnP57716 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NcstnP57716 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NcstnP57716 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NcstnP57716 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NcstnP57716 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms