Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp25P57080 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp25P57080 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp25P57080 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp25P57080 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp25P57080 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp25P57080 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp25P57080 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp25P57080 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp25P57080 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms