Protein–RNA interactions for Protein: P56564

Slc1a3, Excitatory amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a3P56564 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc1a3P56564 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Slc1a3P56564 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms