Protein–RNA interactions for Protein: P56389

Cda, Cytidine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdaP56389 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CdaP56389 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CdaP56389 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CdaP56389 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CdaP56389 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CdaP56389 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CdaP56389 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CdaP56389 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CdaP56389 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CdaP56389 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CdaP56389 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CdaP56389 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CdaP56389 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CdaP56389 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CdaP56389 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CdaP56389 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CdaP56389 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CdaP56389 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CdaP56389 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CdaP56389 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CdaP56389 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CdaP56389 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CdaP56389 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CdaP56389 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CdaP56389 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CdaP56389 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CdaP56389 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CdaP56389 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CdaP56389 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CdaP56389 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CdaP56389 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CdaP56389 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CdaP56389 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CdaP56389 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CdaP56389 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CdaP56389 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CdaP56389 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CdaP56389 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CdaP56389 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CdaP56389 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CdaP56389 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CdaP56389 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CdaP56389 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CdaP56389 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CdaP56389 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CdaP56389 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CdaP56389 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CdaP56389 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CdaP56389 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CdaP56389 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CdaP56389 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CdaP56389 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CdaP56389 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CdaP56389 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CdaP56389 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CdaP56389 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CdaP56389 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CdaP56389 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CdaP56389 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CdaP56389 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CdaP56389 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CdaP56389 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CdaP56389 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CdaP56389 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CdaP56389 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CdaP56389 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CdaP56389 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CdaP56389 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CdaP56389 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CdaP56389 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CdaP56389 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CdaP56389 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CdaP56389 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CdaP56389 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CdaP56389 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CdaP56389 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CdaP56389 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CdaP56389 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CdaP56389 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CdaP56389 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CdaP56389 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CdaP56389 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CdaP56389 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CdaP56389 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CdaP56389 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CdaP56389 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CdaP56389 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CdaP56389 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CdaP56389 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CdaP56389 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CdaP56389 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CdaP56389 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CdaP56389 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CdaP56389 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CdaP56389 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CdaP56389 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CdaP56389 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CdaP56389 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CdaP56389 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CdaP56389 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms