Protein–RNA interactions for Protein: P55065

Pltp, Phospholipid transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PltpP55065 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PltpP55065 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PltpP55065 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PltpP55065 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PltpP55065 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PltpP55065 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PltpP55065 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PltpP55065 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PltpP55065 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PltpP55065 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PltpP55065 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PltpP55065 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PltpP55065 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PltpP55065 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PltpP55065 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PltpP55065 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PltpP55065 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PltpP55065 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PltpP55065 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PltpP55065 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PltpP55065 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PltpP55065 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PltpP55065 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PltpP55065 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PltpP55065 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PltpP55065 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PltpP55065 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PltpP55065 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PltpP55065 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PltpP55065 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PltpP55065 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PltpP55065 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PltpP55065 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PltpP55065 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PltpP55065 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PltpP55065 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PltpP55065 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PltpP55065 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PltpP55065 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PltpP55065 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PltpP55065 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PltpP55065 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PltpP55065 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PltpP55065 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PltpP55065 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PltpP55065 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PltpP55065 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PltpP55065 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PltpP55065 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PltpP55065 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PltpP55065 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PltpP55065 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PltpP55065 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PltpP55065 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PltpP55065 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PltpP55065 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PltpP55065 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PltpP55065 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PltpP55065 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PltpP55065 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PltpP55065 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PltpP55065 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PltpP55065 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PltpP55065 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PltpP55065 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PltpP55065 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PltpP55065 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PltpP55065 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PltpP55065 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PltpP55065 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PltpP55065 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PltpP55065 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PltpP55065 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PltpP55065 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PltpP55065 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PltpP55065 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PltpP55065 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PltpP55065 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PltpP55065 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PltpP55065 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PltpP55065 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PltpP55065 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PltpP55065 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PltpP55065 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PltpP55065 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PltpP55065 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PltpP55065 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PltpP55065 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PltpP55065 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PltpP55065 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PltpP55065 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PltpP55065 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PltpP55065 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PltpP55065 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PltpP55065 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PltpP55065 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PltpP55065 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PltpP55065 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PltpP55065 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PltpP55065 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms