Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Faf1P54731 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Faf1P54731 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Faf1P54731 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Faf1P54731 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Faf1P54731 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Faf1P54731 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Faf1P54731 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Faf1P54731 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Faf1P54731 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Faf1P54731 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Faf1P54731 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms