Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fdft1P53798 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Fdft1P53798 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms