Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cux1P53564 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cux1P53564 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cux1P53564 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cux1P53564 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cux1P53564 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cux1P53564 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cux1P53564 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cux1P53564 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cux1P53564 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cux1P53564 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cux1P53564 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cux1P53564 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Cux1P53564 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cux1P53564 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cux1P53564 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cux1P53564 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Cux1P53564 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cux1P53564 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cux1P53564 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cux1P53564 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cux1P53564 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cux1P53564 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cux1P53564 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cux1P53564 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cux1P53564 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cux1P53564 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cux1P53564 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cux1P53564 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cux1P53564 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cux1P53564 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cux1P53564 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Cux1P53564 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cux1P53564 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cux1P53564 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cux1P53564 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cux1P53564 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cux1P53564 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Cux1P53564 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cux1P53564 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cux1P53564 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cux1P53564 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cux1P53564 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cux1P53564 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cux1P53564 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cux1P53564 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cux1P53564 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Cux1P53564 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cux1P53564 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cux1P53564 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cux1P53564 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cux1P53564 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cux1P53564 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cux1P53564 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cux1P53564 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cux1P53564 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cux1P53564 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cux1P53564 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Cux1P53564 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cux1P53564 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cux1P53564 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cux1P53564 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cux1P53564 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cux1P53564 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cux1P53564 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cux1P53564 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cux1P53564 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cux1P53564 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cux1P53564 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Cux1P53564 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cux1P53564 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Cux1P53564 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cux1P53564 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cux1P53564 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Cux1P53564 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cux1P53564 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cux1P53564 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cux1P53564 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cux1P53564 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Cux1P53564 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cux1P53564 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cux1P53564 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cux1P53564 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cux1P53564 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cux1P53564 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Cux1P53564 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cux1P53564 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cux1P53564 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cux1P53564 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cux1P53564 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cux1P53564 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cux1P53564 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cux1P53564 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cux1P53564 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cux1P53564 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Cux1P53564 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cux1P53564 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Cux1P53564 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cux1P53564 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cux1P53564 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms