Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Map3k1P53349 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Map3k1P53349 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Map3k1P53349 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Map3k1P53349 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Map3k1P53349 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Map3k1P53349 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Map3k1P53349 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Map3k1P53349 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Map3k1P53349 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Map3k1P53349 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Map3k1P53349 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Map3k1P53349 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Map3k1P53349 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Map3k1P53349 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Map3k1P53349 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Map3k1P53349 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Map3k1P53349 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Map3k1P53349 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Map3k1P53349 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Map3k1P53349 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Map3k1P53349 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Map3k1P53349 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Map3k1P53349 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Map3k1P53349 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Map3k1P53349 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Map3k1P53349 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Map3k1P53349 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Map3k1P53349 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Map3k1P53349 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Map3k1P53349 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Map3k1P53349 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Map3k1P53349 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Map3k1P53349 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Map3k1P53349 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Map3k1P53349 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Map3k1P53349 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Map3k1P53349 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Map3k1P53349 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Map3k1P53349 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Map3k1P53349 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Map3k1P53349 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Map3k1P53349 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
Map3k1P53349 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Map3k1P53349 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Map3k1P53349 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Map3k1P53349 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Map3k1P53349 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Map3k1P53349 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Map3k1P53349 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Map3k1P53349 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Map3k1P53349 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Map3k1P53349 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Map3k1P53349 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Map3k1P53349 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Map3k1P53349 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Map3k1P53349 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Map3k1P53349 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Map3k1P53349 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Map3k1P53349 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Map3k1P53349 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Map3k1P53349 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Map3k1P53349 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Map3k1P53349 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Map3k1P53349 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Map3k1P53349 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Map3k1P53349 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Map3k1P53349 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Map3k1P53349 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Map3k1P53349 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Map3k1P53349 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Map3k1P53349 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Map3k1P53349 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Map3k1P53349 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Map3k1P53349 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Map3k1P53349 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Map3k1P53349 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Map3k1P53349 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Map3k1P53349 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Map3k1P53349 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Map3k1P53349 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Map3k1P53349 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Map3k1P53349 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Map3k1P53349 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Map3k1P53349 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Map3k1P53349 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Map3k1P53349 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Map3k1P53349 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Map3k1P53349 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Map3k1P53349 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Map3k1P53349 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Map3k1P53349 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Map3k1P53349 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Map3k1P53349 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Map3k1P53349 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Map3k1P53349 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Map3k1P53349 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Map3k1P53349 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Map3k1P53349 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Map3k1P53349 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms